El investigador puede acceder directamente a nuestra Biblioteca Auxiliar, que consta de unos 3.000 ejemplares y está especializada en Archivística, Historia de la Iglesia e Historia de Vasconia. La biblioteca se completa además con una sección de referencia, así como con libros de otros temas, como Genealogía y Heráldica, Arte, Biblioteconomía, etc.
Sin embargo, los libros anteriores al siglo XIX procedentes de las parroquias que por su rareza o especial singularidad han pasado a formar parte de nuestra Biblioteca Reservada son, a causa de su valor e interés, de acceso restringido y, para consultarlos, debe solicitarse el pertinente permiso.